利用已公開的數(shù)百萬個基因組序列
新冠病毒進(jìn)化研究有了新視角
美國和瑞士科學(xué)家在生物預(yù)印本網(wǎng)站（bioRxiv）提交論文稱，他們利用已經(jīng)公開的數(shù)百萬個新冠病毒的基因組序列，以前所未有的方式對其進(jìn)化情況開展了研究，揭示了新冠病毒為了存活必須處于特定狀態(tài)且能耐受變化的基因位點。這一發(fā)現(xiàn)有助科學(xué)家開發(fā)出靶向新冠病毒某些蛋白的新型藥物。
研究人員指出，通過監(jiān)測新冠病毒變異株的生長情況，他們有可能識別出一些對病毒生長有利的病毒核糖核酸（RNA）單個堿基字母的突變。這些堿基字母與構(gòu)成病毒基因主干的四個堿基有關(guān)，但這些單字母突變只是所有可能出現(xiàn)突變的一小部分。
新冠病毒每個RNA單字母可能平均突變了15000次。數(shù)以百萬計新冠病毒測序樣本為研究人員提供了評估這些自然實驗結(jié)果的方法。
在最新研究中，美國弗雷德•哈欽森癌癥中心和瑞士巴塞爾大學(xué)研究人員使用數(shù)百萬個已公開的新冠病毒基因組序列，首先統(tǒng)計了已知所有單字母突變均為中性的位點發(fā)生突變的頻率，因為這不會導(dǎo)致蛋白質(zhì)序列發(fā)生任何變化，所以得到的結(jié)果會指出在不影響病毒適應(yīng)性的情況下，任何位點發(fā)生突變的頻率。然后，他們將每個位點觀察到的突變數(shù)量與預(yù)期數(shù)量進(jìn)行比較，并將結(jié)果映射到新冠病毒所有蛋白上，以揭示病毒要生存并傳播，哪些位點必須處于特定狀態(tài)，哪些位點可以耐受變化。
研究人員稱，這一發(fā)現(xiàn)有助于科學(xué)家開發(fā)出靶向新冠病毒某些蛋白的新型藥物，這些蛋白通常不易通過變異來逃避現(xiàn)有藥物的攻擊。
科技日報（2023年02月13日04版）
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